Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim13Q9CYB0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim13Q9CYB0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms