Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms