Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot11Q9CWN7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Cnot11Q9CWN7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot11Q9CWN7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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