Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Sycp2Q9CUU3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Sycp2Q9CUU3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Sycp2Q9CUU3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms