Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhfpl3Q9CTN8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms