Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gnpda2Q9CRC9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gnpda2Q9CRC9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gnpda2Q9CRC9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gnpda2Q9CRC9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gnpda2Q9CRC9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gnpda2Q9CRC9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gnpda2Q9CRC9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gnpda2Q9CRC9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gnpda2Q9CRC9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gnpda2Q9CRC9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gnpda2Q9CRC9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gnpda2Q9CRC9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gnpda2Q9CRC9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gnpda2Q9CRC9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gnpda2Q9CRC9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gnpda2Q9CRC9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gnpda2Q9CRC9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gnpda2Q9CRC9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms