Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc2Q9CQP2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms