Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rwdd1Q9CQK7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms