Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ4

Rnf2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf2Q9CQJ4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf2Q9CQJ4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms