Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms