Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms