Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms