Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Med4Q9CQA5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Med4Q9CQA5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms