Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sike1Q9CPR7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sike1Q9CPR7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms