Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Bcl11bQ99PV8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms