Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms