Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clint1Q99KN9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms