Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CsprsQ99388 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CsprsQ99388 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CsprsQ99388 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CsprsQ99388 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CsprsQ99388 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CsprsQ99388 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CsprsQ99388 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CsprsQ99388 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CsprsQ99388 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.3 ms