Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms