Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Alpk3Q924C5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Alpk3Q924C5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Alpk3Q924C5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Alpk3Q924C5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Alpk3Q924C5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Alpk3Q924C5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Alpk3Q924C5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Alpk3Q924C5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Alpk3Q924C5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Alpk3Q924C5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Alpk3Q924C5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Alpk3Q924C5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Alpk3Q924C5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Alpk3Q924C5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Alpk3Q924C5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Alpk3Q924C5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Alpk3Q924C5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Alpk3Q924C5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Alpk3Q924C5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Alpk3Q924C5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Alpk3Q924C5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Alpk3Q924C5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Alpk3Q924C5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Alpk3Q924C5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms