Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms