Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q2

Riok1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok1Q922Q2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Riok1Q922Q2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riok1Q922Q2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Riok1Q922Q2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms