Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb6Q922F4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms