Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR1

Rab4b, Ras-related protein Rab-4B, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4bQ91ZR1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4bQ91ZR1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab4bQ91ZR1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms