Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc5a4bQ91ZP4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc5a4bQ91ZP4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc5a4bQ91ZP4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms