Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx4Q91YJ2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms