Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg13Q91YI1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms