Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacng5Q8VHW4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms