Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Uhrf1Q8VDF2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Uhrf1Q8VDF2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Uhrf1Q8VDF2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Uhrf1Q8VDF2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Uhrf1Q8VDF2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Uhrf1Q8VDF2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Uhrf1Q8VDF2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1Q8VDF2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms