Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Sft2d2Q8VD57 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sft2d2Q8VD57 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sft2d2Q8VD57 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sft2d2Q8VD57 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sft2d2Q8VD57 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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