Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ApobrQ8VBT6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms