Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms