Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4G1

Ltbp4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp4Q8K4G1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ltbp4Q8K4G1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ltbp4Q8K4G1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ltbp4Q8K4G1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ltbp4Q8K4G1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ltbp4Q8K4G1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ltbp4Q8K4G1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ltbp4Q8K4G1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ltbp4Q8K4G1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ltbp4Q8K4G1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ltbp4Q8K4G1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ltbp4Q8K4G1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ltbp4Q8K4G1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ltbp4Q8K4G1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ltbp4Q8K4G1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ltbp4Q8K4G1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Ltbp4Q8K4G1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ltbp4Q8K4G1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms