Protein–RNA interactions for Protein: Q8K449

Abca9, ATP-binding cassette sub-family A member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca9Q8K449 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Abca9Q8K449 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Abca9Q8K449 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Abca9Q8K449 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Abca9Q8K449 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Abca9Q8K449 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Abca9Q8K449 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abca9Q8K449 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abca9Q8K449 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abca9Q8K449 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abca9Q8K449 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Abca9Q8K449 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms