Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufs8Q8K3J1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms