Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms