Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otud6bQ8K2H2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud6bQ8K2H2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms