Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Arfip2Q8K221 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfip2Q8K221 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms