Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33aQ8K0Y2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33aQ8K0Y2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33aQ8K0Y2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33aQ8K0Y2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33aQ8K0Y2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33aQ8K0Y2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33aQ8K0Y2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33aQ8K0Y2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33aQ8K0Y2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt33aQ8K0Y2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt33aQ8K0Y2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt33aQ8K0Y2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt33aQ8K0Y2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt33aQ8K0Y2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt33aQ8K0Y2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt33aQ8K0Y2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt33aQ8K0Y2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt33aQ8K0Y2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt33aQ8K0Y2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt33aQ8K0Y2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt33aQ8K0Y2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt33aQ8K0Y2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt33aQ8K0Y2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt33aQ8K0Y2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt33aQ8K0Y2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt33aQ8K0Y2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt33aQ8K0Y2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms