Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syne4Q8CII8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syne4Q8CII8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms