Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms