Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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9030612E09RikQ8CE20 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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9030612E09RikQ8CE20 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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9030612E09RikQ8CE20 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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9030612E09RikQ8CE20 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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9030612E09RikQ8CE20 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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9030612E09RikQ8CE20 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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9030612E09RikQ8CE20 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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9030612E09RikQ8CE20 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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9030612E09RikQ8CE20 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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9030612E09RikQ8CE20 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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9030612E09RikQ8CE20 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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9030612E09RikQ8CE20 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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9030612E09RikQ8CE20 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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9030612E09RikQ8CE20 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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9030612E09RikQ8CE20 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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9030612E09RikQ8CE20 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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