Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY8

Dctn4, Dynactin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn4Q8CBY8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn4Q8CBY8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn4Q8CBY8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn4Q8CBY8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn4Q8CBY8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn4Q8CBY8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn4Q8CBY8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn4Q8CBY8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn4Q8CBY8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn4Q8CBY8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn4Q8CBY8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn4Q8CBY8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn4Q8CBY8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn4Q8CBY8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn4Q8CBY8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn4Q8CBY8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn4Q8CBY8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn4Q8CBY8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn4Q8CBY8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn4Q8CBY8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn4Q8CBY8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn4Q8CBY8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn4Q8CBY8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn4Q8CBY8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn4Q8CBY8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn4Q8CBY8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms