Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe22Q8C6A8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe22Q8C6A8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe22Q8C6A8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms