Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Snx16Q8C080 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Snx16Q8C080 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx16Q8C080 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Snx16Q8C080 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Snx16Q8C080 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx16Q8C080 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms