Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TnrQ8BYI9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms