Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms