Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpc2Q8BKV1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpc2Q8BKV1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpc2Q8BKV1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpc2Q8BKV1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpc2Q8BKV1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpc2Q8BKV1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpc2Q8BKV1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpc2Q8BKV1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpc2Q8BKV1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms