Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
D130040H23RikQ8BII3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
D130040H23RikQ8BII3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
D130040H23RikQ8BII3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
D130040H23RikQ8BII3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
D130040H23RikQ8BII3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
D130040H23RikQ8BII3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
D130040H23RikQ8BII3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms