Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe23Q8BGW3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms